prikaz prve stranice dokumenta Analiza genomskog potencijala za formiranje biofilma bakterije Vibrio gigantis
  Preuzmi
PDF 3.34 MB
diplomski rad
Analiza genomskog potencijala za formiranje biofilma bakterije Vibrio gigantis
2023. urn:nbn:hr:166:072077
Vukman, Vana Marta
Sveučilište u Splitu
Prirodoslovno-matematički fakultet
Odjel za biologiju

Citirajte ovaj rad

Vukman, V. M. (2023). Analiza genomskog potencijala za formiranje biofilma bakterije Vibrio gigantis (Diplomski rad). Split: Sveučilište u Splitu, Prirodoslovno-matematički fakultet. Preuzeto s https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:166:072077

Vukman, Vana Marta. "Analiza genomskog potencijala za formiranje biofilma bakterije Vibrio gigantis." Diplomski rad, Sveučilište u Splitu, Prirodoslovno-matematički fakultet, 2023. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:166:072077

Vukman, Vana Marta. "Analiza genomskog potencijala za formiranje biofilma bakterije Vibrio gigantis." Diplomski rad, Sveučilište u Splitu, Prirodoslovno-matematički fakultet, 2023. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:166:072077

Vukman, V. M. (2023). 'Analiza genomskog potencijala za formiranje biofilma bakterije Vibrio gigantis', Diplomski rad, Sveučilište u Splitu, Prirodoslovno-matematički fakultet, citirano: 14.04.2024., https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:166:072077

Vukman VM. Analiza genomskog potencijala za formiranje biofilma bakterije Vibrio gigantis [Diplomski rad]. Split: Sveučilište u Splitu, Prirodoslovno-matematički fakultet; 2023 [pristupljeno 14.04.2024.] Dostupno na: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:166:072077

V. M. Vukman, "Analiza genomskog potencijala za formiranje biofilma bakterije Vibrio gigantis", Diplomski rad, Sveučilište u Splitu, Prirodoslovno-matematički fakultet, Split, 2023. Dostupno na: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:166:072077

Za citiranje koristite ovu mrežnu adresu: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:166:072077
Prijavite se u repozitorij kako biste mogli spremiti objekt u svoju listu.
Podaci o radu
NaslovAnaliza genomskog potencijala za formiranje biofilma bakterije Vibrio gigantis
Naslov (engleski)Analysis of genomic potential for biofilm formation of Vibrio gigantis
AutorVana Marta Vukman
MentorIvica Šamanić (mentor)
MentorMarin Ordulj (komentor)
Član povjerenstvaIvica Šamanić (predsjednik povjerenstva)
Član povjerenstvaAna Maravić (član povjerenstva)
Član povjerenstvaMarin Ordulj (član povjerenstva)
Ustanova koja je dodijelila
akademski / stručni stupanj		Sveučilište u Splitu
Prirodoslovno-matematički fakultet
(Odjel za biologiju)
Split
Datum i država obrane2023-09-29, Hrvatska
Znanstveno / umjetničko
područje, polje i grana		PRIRODNE ZNANOSTI
Biologija
Sažetak
Stanična komunikacija signalnim molekulama QS (engl. Quorum sensing) važan je regulatorni mehanizam koji koriste mnoge bakterijske vrste za koordinaciju ekspresije gena i ponašanja kao odgovor na promjene u gustoći populacije. U kontekstu stvaranja biofilma, stanična komunikacija QS vrlo je složen i strogo reguliran proces koji uključuje proizvodnju i detekciju specifičnih signalnih molekula kao što su autoinduktori. Autoinduktor 2 (AI-2) je od posebne važnosti za bakterijsku komunikaciju i razvoj biofilma. Prisutnost gena stanične komunikacije putem AI-2 kemijskih signalnih molekula (engl. Lux quorum) u bakterije Vibrio gigantis, uključujući luxPQ, luxU i luxO je intrigantna jer su ti geni općenito uključeni u regulaciju bioluminiscencije u drugim vrstama roda Vibrio. Međutim, nepostojanje transkripcijskog aktivatora LuxR i operona luciferaze (luxCDABEGH), odgovornih za proizvodnju enzima luciferaze koji su kritični za bioluminiscenciju, sugerira jedinstvenu genetsku konfiguraciju vrste V. gigantis. Kombinirani rezultati PICRUSt analize i eksperimentalnog testa bioluminiscencije, kao i promatranje dinamike formiranja mikrokolonija i stanica roja, potvrđuju kako V. gigantis ima genetski potencijal za stvaranje biofilmova pomoću sustava QS, ali nema sposobnost bioluminiscencije. Ovo je empirijski dokaz kako V. gigantis koristi mehanizme QS različite od drugih bioluminiscentnih vrsta i ukazuje na različite strategije koje bakterije koriste kako bi koordinirali svoje ponašanje u biofilmovima.
Sažetak (engleski)
Quorum sensing (QS) is an important regulatory mechanism used by many bacterial species to coordinate gene expression and behavior in response to changes in population density. In the context of biofilm formation, quorum sensing is a highly complex and tightly regulated process that involves the production and detection of specific signaling molecules such as autoinducer 2 (AI-2), which is of particular importance for bacterial communication and biofilm development. The presence of genes associated with the Lux quorum-sensing system in Vibrio gigantis, including luxPQ, luxU, and luxO, is intriguing because these genes are generally involved in the regulation of bioluminescence in other Vibrio species. However, the absence of the transcriptional activator LuxR and the luciferase operon (luxCDABEGH), which are responsible for the production of the enzyme luciferase that is critical for bioluminescence, suggests a unique genetic configuration in V. gigantis. The combined results of the PICRUSt analysis and the experimental bioluminescence assay, as well as the observation of the dynamics of microcolony and swarm cell formation, confirm that V. gigantis has the genetic potential to form biofilms through quorum sensing, but lacks the ability to bioluminesce. This is empirical evidence that V. gigantis uses QS mechanisms distinct from bioluminescent species and sheds light on the different strategies bacteria employ to coordinate their behavior in biofilms.
Ključne riječi
Ključne riječi (engleski)
Jezikhrvatski
URN:NBNurn:nbn:hr:166:072077
Studijski programNaziv: Biologija i kemija; smjerovi: nastavnički
Smjer: nastavnički
Vrsta studija: sveučilišni
Stupanj studija: diplomski
Akademski / stručni naziv: magistar/magistra edukacije biologije i kemije (mag. educ. biol. et chem.)
Vrsta resursaTekst
Način izrade datotekeIzvorno digitalna
Prava pristupaOtvoreni pristup
Uvjeti korištenjaIkona licence Imenovanje 4.0 međunarodna (CC BY 4.0)
Datum i vrijeme pohrane2023-10-04 10:53:09