prikaz prve stranice dokumenta Optimization of giant unilamellar vesicle electroformation for different lipid mixtures with a focus on high cholesterol concentrations
  Preuzmi
PDF 19.8 MB
disertacija
Optimization of giant unilamellar vesicle electroformation for different lipid mixtures with a focus on high cholesterol concentrations
2023. urn:nbn:hr:166:553755
Boban, Zvonimir
Sveučilište u Splitu
Prirodoslovno-matematički fakultet
Odjel za fiziku

Citirajte ovaj rad

Boban, Z. (2023). Optimization of giant unilamellar vesicle electroformation for different lipid mixtures with a focus on high cholesterol concentrations (Disertacija). Split: Sveučilište u Splitu, Prirodoslovno-matematički fakultet. Preuzeto s https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:166:553755

Boban, Zvonimir. "Optimization of giant unilamellar vesicle electroformation for different lipid mixtures with a focus on high cholesterol concentrations." Disertacija, Sveučilište u Splitu, Prirodoslovno-matematički fakultet, 2023. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:166:553755

Boban, Zvonimir. "Optimization of giant unilamellar vesicle electroformation for different lipid mixtures with a focus on high cholesterol concentrations." Disertacija, Sveučilište u Splitu, Prirodoslovno-matematički fakultet, 2023. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:166:553755

Boban, Z. (2023). 'Optimization of giant unilamellar vesicle electroformation for different lipid mixtures with a focus on high cholesterol concentrations', Disertacija, Sveučilište u Splitu, Prirodoslovno-matematički fakultet, citirano: 19.11.2024., https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:166:553755

Boban Z. Optimization of giant unilamellar vesicle electroformation for different lipid mixtures with a focus on high cholesterol concentrations [Disertacija]. Split: Sveučilište u Splitu, Prirodoslovno-matematički fakultet; 2023 [pristupljeno 19.11.2024.] Dostupno na: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:166:553755

Z. Boban, "Optimization of giant unilamellar vesicle electroformation for different lipid mixtures with a focus on high cholesterol concentrations", Disertacija, Sveučilište u Splitu, Prirodoslovno-matematički fakultet, Split, 2023. Dostupno na: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:166:553755

Za citiranje koristite ovu mrežnu adresu: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:166:553755
Prijavite se u repozitorij kako biste mogli spremiti objekt u svoju listu.
Podaci o radu
NaslovOptimization of giant unilamellar vesicle electroformation for different lipid mixtures with a focus on high cholesterol concentrations
Naslov (hrvatski)Optimizacija elektroformacije divovskih unilamelarnih vezikula za različite lipidne smjese uz naglasak na visoke koncentracije kolesterola
AutorZvonimir Boban
MentorMarija Raguž (mentor)
Član povjerenstvaMile Dželalija (predsjednik povjerenstva)
Član povjerenstvaDamir Sapunar (član povjerenstva)
Član povjerenstvaLucija Krce (član povjerenstva)
Ustanova koja je dodijelila
akademski / stručni stupanj		Sveučilište u Splitu
Prirodoslovno-matematički fakultet
(Odjel za fiziku)
Split
Datum i država obrane2023-04-27, Hrvatska
Znanstveno / umjetničko
područje, polje i grana		PRIRODNE ZNANOSTI
Fizika
Univerzalna decimalna klasifikacija
(UDC)		577 - Biokemija. Molekularna biologija. Biofizika
Sažetak
Giant unilamellar vesicles (GUVs) are widely used as artificial cell membrane models. Electroformation is the most commonly used method for their production. The method depends on multiple parameters, so reproducible production of high quality GUVs can be challenging, especially when working with lipid mixtures containing cholesterol concentrations reaching and surpassing the bilayer saturation threshold. After analyzing existing electroformation protocols, we identified two key issues for such mixtures. The first issue is related to experiment reproducibility. Most protocols use the drop-deposition method which produces lipid films of nonuniform thickness, resulting in lower experiment reproducibility and efficiency of GUV formation. The second is cholesterol demixing in the form of anhydrous crystals during lipid film drying, resulting in an artifactual decrease of cholesterol concentration in GUVs compared to the initial lipid mixture. To deal with the first problem, we first tested electroformation from such mixtures with replacement of the drop-deposition step by spin-coating. Optimizing this process improved the GUV size and yield, but the cholesterol demixing issue remained. To address this issue, we developed a new protocol which combines the rapid solvent exchange, plasma cleaning and spin-coating techniques to produce GUVs by electroformation from damp lipid films. We believe that this new improved electroformation protocol will allow us to successfully study models of eye lens fiber cell membranes with their very high Chol content.
Sažetak (hrvatski)
Divovske unilamelarne vezikule (DUV) naširoko se koriste kao modeli staničnih membrana. Elektroformacija je najčešće korištena metoda za njihovu proizvodnju. Metoda ovisi o više parametara, tako da ponovljiva proizvodnja visokokvalitetnih DUV-ova može biti izazovna, osobito pri radu s lipidnim smjesama koje sadrže koncentracije kolesterola koje dosežu i premašuju prag zasićenja membranskog dvosloja. Nakon analize postojećih protokola elektroformacije, identificirali smo dva ključna problema za takve smjese. Prvi se odnosi na ponovljivost eksperimenata. Većina protokola koristi metodu nakapavanja koja proizvodi lipidne filmove nejednake debljine, što rezultira smanjenom ponovljivošću eksperimenata i učinkovitošću stvaranja DUV-ova. Drugi je izlučivanje kolesterola u obliku dehidriranih kristala tijekom sušenja lipidnog filma, što dovodi do artefaktualnog smanjenja koncentracije kolesterola u DUV-ovima u usporedbi s početnom lipidnom smjesom. Kako bismo umanjili prvi problem, testirali smo elektroformaciju iz takvih smjesa uz zamjenu koraka nakapavanja tehnikom brzog razmazivanja. Optimizacija ovog procesa poboljšala je veličinu i prinos DUV-ova, ali i dalje je preostalo pitanje izlučivanja kolesterola. Potaknuti time, razvili smo novi protokol koji kombinira tehnike brze izmjene otapala, čišćenja plazmom i brzog razmazivanja za proizvodnju DUV-ova elektroformacijom iz vlažnih lipidnih filmova. Smatramo da će nam ovaj novi protokol pomoći u daljnjem istraživanju svojstava membrana s vrlo visokim udjelom kolesterola, poput vlaknastih stanica leće oka.
Ključne riječi
Ključne riječi (hrvatski)
Jezikengleski
URN:NBNurn:nbn:hr:166:553755
Studijski programNaziv: Biofizika
Vrsta studija: sveučilišni
Stupanj studija: poslijediplomski doktorski
Akademski / stručni naziv: doktor/doktorica znanosti, područje prirodnih znanosti, polje fizika (dr. sc.)
Vrsta resursaTekst
Opseg84 str. ; 30 cm
Način izrade datotekeIzvorno digitalna
Prava pristupaOtvoreni pristup
Uvjeti korištenjaIkona licence Imenovanje-Bez prerada 4.0 međunarodna (CC BY-ND 4.0)
Datum i vrijeme pohrane2023-05-04 12:04:35